基因芯片的zui大優(yōu)點在于其高通量。基因芯片出現(xiàn)之前,研究眾多基因在特定研究體系中的表達變化的手段為原位雜交技術(shù)和NORTHERN技術(shù)。這兩種技術(shù)有其各自優(yōu)點。原位雜交技術(shù)可以定位待檢測基因在組織中分布于哪些細胞類型,而NORTHERN技術(shù)可以顯示待檢測基因的分子量信息。但兩個技術(shù)的致命缺點是極低的通量,即一次實驗過程只能檢測有限的基因。如果想在有限的實驗次數(shù)中檢測眾多基因在特定實驗體系中的變化規(guī)律,這兩種技術(shù)是不可能的。而利用芯片就可以達到這個目的。傳統(tǒng)方法檢測眾多基因要經(jīng)歷多次實驗而且自動化程度低,因而每次實驗之間是存在系統(tǒng)誤差的。基因芯片可以克服這個缺點,眾多基因的探針的標(biāo)記、雜交等過程是在一次實驗過程中完成的,而且自動化程度高,數(shù)據(jù)客觀可靠。
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